Kartoffeln waschen und in einem Topf mit leicht gesalzenem Wasser knapp bedecken. Kartoffeln weich kochen, schälen. Rote Bete in Salzwasser weich kochen, schälen. Wirsing putzen, halbieren, waschen und den Strunk herausschneiden.
Wirsing in wenig Wasser, Salz und Pfeffer bissfest dünsten. Kartoffeln und Rote Bete in Scheiben schneiden. Eine Auflaufform mit Butter fetten und Gemüse darauf verteilen. Milch, Sahne und Eier verquirlen, mit Salz, Pfeffer und geriebener Muskatnuss würzen. Die Masse über dem Gemüse verteilen und die Form für 20–25 Minuten in den auf 180 °C vorgeheizten Backofen geben.
Währenddessen Kräuteröl zubereiten: Kräuter waschen, trocknen und fein hacken. Parmesan reiben, mit Kräutern und Olivenöl vermischen. Kräuteröl mit Salz und Pfeffer abschmecken. Der Auflauf ist fertig, sobald die Eier-Milch gestockt ist und die Oberfläche eine leicht braune Färbung hat. Gemüseauflauf mit Kräuteröl servieren und nach Belieben mit frischen Kräutern (z.B. Majoran oder Thymian) bestreuen.